Bourne Shellに関して独立したページを設けるほどでもないTipsを記載します。
Bourne Shellの名前の由来
変わった名前のシェルですが、開発者の名前 Stephen R. Bourne からきているそうです。
関数の定義とシェルオプション
#!/bin/sh -x
function mvcut_data (){
# $1: file type (a, h, r)
# $2: file number (nnumX)
if [ ! $# -eq 4 ]; then
echo "[${0}] Four arguments must be specified."
exit
fi
cname="h010_l045_v001.190515"
cnum="101"
echo "processing $1 file"
mv $cname.$cnum.${1}.${2}.nc $cname.$cnum.${1}org.${2}.nc
ncks -d ocean_time,${3},${4} $cname.$cnum.${1}org.${2}.nc -o $cname.$cnum.${1}.$nnum0.nc
}
cname="h010_l045_v001.190515"
cnum="101"
### 070+071 -> 070 step1
nnum0=070
nnum1=071
#mvcut_data a $nnum0 0 2
#mvcut_data h $nnum0 0 2
mvcut_data r $nnum0 0 0 - 関数を定義する時は、上記のように function 関数名 () { }の形で記述します。
- シェルスクリプト内の変数は基本的にグローバル変数で、引数として渡さなくても参照できます（逆にできてしまうので注意が必要です）。
- シェルの実行時、あるいは関数の実行時の引数は、位置パラメータと呼ばれる特殊な変数に渡されます。位置パラメータの変数名は$1, $2, $3などです。
- 位置パラメータの変数の数は$#という変数から参照することができます。
- 変数名の区切りを明示するために、$1は${1}と書くことができます。
sedやawkを使った処理
#!/bin/sh
if [ ! $# -eq 1 ]; then
echo "One argument must be specified."
exit
fi
cname="h010_l045_v001.190515.101"
nnum=`printf %03d ${1}`
set a h r
while [ $# -ge 1 ]
do
echo $1
ncks -v ocean_time ${cname}.${1}.${nnum}.nc | \
sed -n -e '/ocean_time = [0123456789]/p' | \
awk '{n=split($0, ary, "="); print(ary[n])}' | \
awk '{n=split($0, ary, ";"); print(ary[1])}' | \
awk '{gsub (/ /,""); print }' |\
awk '{n=split($0, ary, ","); for( i=1; i<=length(ary); i++ ) { printf("%.6f\n",ary[i]/86400/365.25) }}'
echo ""
shift
done- aaaa
- aaa
ファイル名の部分きりだしと数値処理
#!/bin/sh -x
function cut_data (){
# $1: file type (a, h, r)
# $2: nnumX
# $3: cut start
# $4: cut end
if [ ! $# -eq 4 ]; then
echo "[${0}] Four arguments must be specified."
exit
fi
nnum=$2
echo "processing $1 file"
mv -f $cname.$cnum.${1}.${nnum}.nc bak/$cname.$cnum.${1}.${nnum}.nc
ncks -d ocean_time,${3},${4} bak/$cname.$cnum.${1}.${nnum}.nc -o $cname.$cnum.${1}.${nnum}.nc
}
function join_data_2 (){
# $1: file type (a, h, r)
if [ ! $# -eq 1 ]; then
echo "[${0}] One argument must be specified."
exit
fi
echo $cname
echo $cnum
mv -f $cname.$cnum.${1}.${nnum0}.nc bak/$cname.$cnum.${1}.${nnum0}.nc
ncrcat bak/$cname.$cnum.${1}.${nnum0}.nc $cname.$cnum.${1}.${nnum1}.nc -o $cname.$cnum.${1}.${nnum0}.nc
}
function rewind_num (){
# $1 file type (a, h, r)
if [ ! $# -eq 1 ]; then
echo "[${0}] One argument must be specified."
fi
mv ${cname}.${cnum}.${1}.${nnum0}.nc bak/${cname}.${cnum}.${1}.${nnum0}.nc
mv ${cname}.${cnum}.${1}.${nnum1}.nc ${cname}.${cnum}.${1}.${nnum0}.nc
}
function copy_data (){
# $1 file type (a, h, r)
if [ ! $# -eq 1 ]; then
echo "[${0}] One argument must be specified."
exit
fi
cp ${cname}.${cnum}.${1}.${nnum0}.nc ../out/
}
### main ###
cname="h010_l045_v001.190515"
cnum="101"
nnum0="076"
mkdir -p bak
n=$(expr ${nnum0} + 1)
nnum1=$(printf "%03d\n" "${n}")
### 076+077 -> 076
#cut_data a $nnum0 0 2
#cut_data h $nnum0 0 2
#cut_data r $nnum0 0 0
#join_data_2 a
#join_data_2 h
#cut_data r $nnum1 0 0
#rewind_num r
#copy_data a
#copy_data h
#copy_data r- aaaa
特定のファイル番号だけ処理
#!/bin/sh
function get_fnum(){
fname=$1
fnum=`echo $fname | awk '{n=split($1, ary, "."); print(ary[5])}'`
fnum=$((10#${fnum}))
}
## parameters
fnum_str=1
fnum_end=120
flist=`ls *.*.*.nc`
for f in $flist
do
get_fnum $f
if [ $fnum -ge $fnum_str ] && [ $fnum -le $fnum_end ]; then
echo $f
pigz -p 12 $f
fi
done#!/bin/sh
function get_flist(){
# $1: filename
ftype=`echo $1 | awk '{n=split($1,ary0,"."); print(ary0[4])}'`
fnum=`echo $1 | awk '{n=split($1,ary0,"."); print(ary0[5])}'`
fnum=`echo $(( 10#$fnum ))`
}
###
cname="h010_l045_v001.190515.100"
flist=`ls ${cname}.?.*.nc.gz`
ftarget=""
for f in $flist:
do
get_flist $f
if [ $fnum -le 100 ] && [ $ftype = "a" -o $ftype = "h" -o $ftype = "r" -o $ftype = "s" ]; then
ftarget=$ftarget" "$f
fi
done
du -c -m $ftarget